Eigentlich ist es ganz einfach:
1.) Öffne ein neues Bild mit der größe des bildes, dass du transperent haben möchtest
2.) Kopiere das Bild als neue Ebene in das transperente
3.) Wähle mit dem Zauberstab die Stellen aus, die du tranpserent haben möchtest (oder schneide sie mit einem anderen Werkzeug, z.B. lasso, aus)
4.) Speichere das ganze und .gif/.png ab und schon ist es transperent

Probiere es doch mal aus

wenn es nicht klappt, kann ich dir auch gerne noch einmal helfen.